אפרת קליפשטיין נולדה בתל אביב, ישראל בשנת 1971.
בעלת תואר ראשון בפסיכולוגיה וגיאוגרפיה מאוניברסיטת בן גוריון ותואר שני בעיצוב תעשייתי מהטכניון. למדה אמנות במדרשה לאמנות בבית ברל וקדרות במכון האמנותי בית שנייידרמן.
קליפשטיין היא אמנית רב תחומית שמרכז עשייתה בעולמות התלת מימד וההצבה. הציגה תערוכות יחיד וקבוצתיות במוזיאונים וגלריות בארץ ובעולם. זכתה על עשייתה בפרסים ומלגות ועבודותיה נמצאות באוספים פרטיים ומוזיאליים. היא מרצה על אמנות בקתדראות שונות. ניהלה את תכניות הלימודים ב'בית ספר בסיס לאמנות ותרבות' וכיהנה כאוצרת הראשית של אגף הנוער והחינוך לאמנות ע"ש רות במוזיאון ישראל.
כיום היא אוצרת ראשית וסמנכ"לית בכירה ברמת הנדיב.